L'alchimie est une pseudo-science qui tente de créer de l'or à partir de différentes combinaisons. L'une des expériences menées dans ce but donne vie à une race de créatures connues sous le nom de Chemies, conçues pour imiter les choses qui existent dans le monde, telles que les sauterelles. Stockées dans les cartes Chemy de Ride, elles ont été accidentellement libérées toutes en même temps. Houtarou Ichinose se voit confier le Gotchardriver et la mission de récupérer les Chemies. Certains sont amicaux et Houtarou peut fusionner avec eux pour se transformer en Kamen Rider Gotchard. Cependant, s'ils sont influencés par la méchanceté humaine, ils peuvent donner naissance à des monstres connus sous le nom de Malgam. Cette histoire explore la nature du bien et du mal, qui sont les deux faces d'une même pièce.