La capture de Mustafa Atef, soupçonné d'avoir entraîné les terroristes responsables des attentats du 11 septembre, conduit à mettre en place le premier procès militaire depuis 50 ans, qui se tiendra sur le USS Seahawk. AJ décide de défendre Atef et Sturgis se porte volontaire pour l'assister, pendant que Mac et Harm sont chargés de poursuivre. A la recherche d'un témoin, Mac et Webb se rendent dans un camp de prisonniers en Afghanistan, où une révolte met la vie de Mac en danger.