Les derniers Jodi se cachent dans leur base secrète, y entrainant de nouveaux padawans. Alors que les Jodi concentrent leurs efforts vers les groupes séparatistes, le machiavélique Seth cherche a reprendre le pouvoir en utilisant des traitres placés dans le temple Jodi. Sonnen Lightside, qui est maintenant une vraie chevalier Jodi, commence à se douté de quelque chose de louche quand maître Traley Sommerset adopte une attitude inhabituelle...